Вышим органом управления АНО ДПО «УЦ ЭТБ» является Общее собрание учредителей.
Единоличный исполнительный орган АНО ДПО «УЦ ЭТБ» — Директор.
Контрольно-ревизионный орган АНО ДПО «УЦ ЭТБ» — Ревизор (Положение о ревизоре).
Для организации и осуществления учебно-методической и научно-исследовательской работы создан Педагогический совет — все работники, ведущие педагогическую деятельность (Положение о педагогическом совете).
Основные структурные подразделения Учебного центра:
- дирекция (директор, заместитель директора, заместитель директора по производственно-учебной работе, главный бухгалтер, бухгалтер по учету материалов, бухгалтер);
- отдел обучения (начальник, ведущие специалисты, специалисты, преподаватели);
- договорной отдел (начальник, ведущие специалисты, специалисты).